Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM48Q8IWZ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM48Q8IWZ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRIM48Q8IWZ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM48Q8IWZ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM48Q8IWZ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM48Q8IWZ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms