Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAV3Q8IVL0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAV3Q8IVL0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAV3Q8IVL0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAV3Q8IVL0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms