Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG1Q86XK7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG1Q86XK7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSIG1Q86XK7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VSIG1Q86XK7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
VSIG1Q86XK7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms