Protein–RNA interactions for Protein: Q86X10

RALGAPB, Ral GTPase-activating protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPBQ86X10 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
RALGAPBQ86X10 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
RALGAPBQ86X10 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
RALGAPBQ86X10 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RALGAPBQ86X10 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RALGAPBQ86X10 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RALGAPBQ86X10 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RALGAPBQ86X10 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RALGAPBQ86X10 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RALGAPBQ86X10 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RALGAPBQ86X10 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RALGAPBQ86X10 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RALGAPBQ86X10 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RALGAPBQ86X10 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms