Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT9Q86SS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT9Q86SS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT9Q86SS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT9Q86SS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT9Q86SS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms