Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFPL4BQ6ZWI9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL4BQ6ZWI9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL4BQ6ZWI9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFPL4BQ6ZWI9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL4BQ6ZWI9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1407.6 ms