Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND4Q6ZU67 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEND4Q6ZU67 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND4Q6ZU67 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEND4Q6ZU67 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms