Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACS1Q6VY07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PACS1Q6VY07 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PACS1Q6VY07 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS1Q6VY07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms