Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRSAM1Q6UWE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRSAM1Q6UWE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRSAM1Q6UWE0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRSAM1Q6UWE0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRSAM1Q6UWE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRSAM1Q6UWE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRSAM1Q6UWE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRSAM1Q6UWE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRSAM1Q6UWE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRSAM1Q6UWE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRSAM1Q6UWE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRSAM1Q6UWE0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRSAM1Q6UWE0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRSAM1Q6UWE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRSAM1Q6UWE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRSAM1Q6UWE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms