Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6Q795 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6Q795 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6Q795 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6Q795 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6Q795 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q6Q795 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6Q795 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6Q795 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6Q795 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6Q795 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6Q795 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q6Q795 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6Q795 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6Q795 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6Q795 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6Q795 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q6Q795 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6Q795 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6Q795 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6Q795 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q6Q795 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6Q795 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6Q795 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6Q795 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6Q795 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6Q795 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6Q795 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q6Q795 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6Q795 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6Q795 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6Q795 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6Q795 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6Q795 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6Q795 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6Q795 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6Q795 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6Q795 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6Q795 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6Q795 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6Q795 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6Q795 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6Q795 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6Q795 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6Q795 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6Q795 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6Q795 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6Q795 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6Q795 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6Q795 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6Q795 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6Q795 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6Q795 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6Q795 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6Q795 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6Q795 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6Q795 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6Q795 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6Q795 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6Q795 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6Q795 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6Q795 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6Q795 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6Q795 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6Q795 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6Q795 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q6Q795 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q6Q795 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q6Q795 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q6Q795 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q6Q795 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6Q795 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6Q795 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6Q795 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6Q795 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6Q795 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6Q795 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6Q795 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6Q795 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6Q795 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6Q795 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6Q795 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6Q795 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6Q795 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6Q795 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6Q795 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms