Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PKN3Q6P5Z2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN3Q6P5Z2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PKN3Q6P5Z2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKN3Q6P5Z2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PKN3Q6P5Z2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN3Q6P5Z2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms