Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALRD1Q5VYJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MALRD1Q5VYJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MALRD1Q5VYJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms