Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPNQ5VXI9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIPNQ5VXI9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIPNQ5VXI9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPNQ5VXI9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPNQ5VXI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPNQ5VXI9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms