Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GARNL3Q5VVW2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GARNL3Q5VVW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GARNL3Q5VVW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARNL3Q5VVW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms