Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SFMBT2Q5VUG0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SFMBT2Q5VUG0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFMBT2Q5VUG0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SFMBT2Q5VUG0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SFMBT2Q5VUG0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms