Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1orf53Q5VUE5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C1orf53Q5VUE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf53Q5VUE5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf53Q5VUE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C1orf53Q5VUE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C1orf53Q5VUE5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C1orf53Q5VUE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C1orf53Q5VUE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C1orf53Q5VUE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C1orf53Q5VUE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C1orf53Q5VUE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms