Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA46Q5T0L3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA46Q5T0L3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA46Q5T0L3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA46Q5T0L3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA46Q5T0L3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms