Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF3Q3KNV8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF3Q3KNV8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF3Q3KNV8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF3Q3KNV8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms