Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NBPF1Q3BBV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
NBPF1Q3BBV0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NBPF1Q3BBV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NBPF1Q3BBV0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NBPF1Q3BBV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NBPF1Q3BBV0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NBPF1Q3BBV0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NBPF1Q3BBV0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NBPF1Q3BBV0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NBPF1Q3BBV0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NBPF1Q3BBV0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NBPF1Q3BBV0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NBPF1Q3BBV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NBPF1Q3BBV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NBPF1Q3BBV0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NBPF1Q3BBV0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
NBPF1Q3BBV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NBPF1Q3BBV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NBPF1Q3BBV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF1Q3BBV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NBPF1Q3BBV0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms