Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PROX2Q3B8N5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROX2Q3B8N5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROX2Q3B8N5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROX2Q3B8N5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms