Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPEL1Q2QD12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPEL1Q2QD12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPEL1Q2QD12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms