Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX9

C2orf68, UPF0561 protein C2orf68, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf68Q2NKX9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf68Q2NKX9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf68Q2NKX9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf68Q2NKX9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf68Q2NKX9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf68Q2NKX9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms