Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2D7

TBC1D28, TBC1 domain family member 28, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D28Q2M2D7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D28Q2M2D7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D28Q2M2D7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D28Q2M2D7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBC1D28Q2M2D7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBC1D28Q2M2D7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBC1D28Q2M2D7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.4 ms