Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
COL24A1Q17RW2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL24A1Q17RW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
COL24A1Q17RW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
COL24A1Q17RW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
COL24A1Q17RW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL24A1Q17RW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL24A1Q17RW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL24A1Q17RW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms