Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBR1Q16650 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBR1Q16650 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBR1Q16650 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBR1Q16650 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBR1Q16650 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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