Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms