Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF239Q16600 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF239Q16600 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF239Q16600 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF239Q16600 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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