Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11BQ15907 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11BQ15907 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
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RAB11BQ15907 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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RAB11BQ15907 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11BQ15907 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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RAB11BQ15907 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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RAB11BQ15907 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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RAB11BQ15907 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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RAB11BQ15907 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11BQ15907 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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