Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SF3B3Q15393 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SF3B3Q15393 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B3Q15393 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SF3B3Q15393 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SF3B3Q15393 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SF3B3Q15393 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SF3B3Q15393 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
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