Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-10■■■■■ 77.9
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PCBP2Q15366 UBE2F-219ENST00000455999 760 ntTSL 513.57□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-213ENST00000439780 571 ntTSL 59.96□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 77.9
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PCBP2Q15366 UBE2F-210ENST00000434137 472 ntTSL 59.52□□□□□ -0.891e-10■■■■■ 77.9
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PCBP2Q15366 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 77.9
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PCBP2Q15366 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 77.8
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PCBP2Q15366 SETD4-212ENST00000446166 754 ntTSL 310.23□□□□□ -0.773e-15■■■■■ 77.6
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PCBP2Q15366 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.83e-15■■■■■ 77.6
PCBP2Q15366 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-15■■■■■ 77.6
PCBP2Q15366 SETD4-209ENST00000429161 745 ntTSL 28.73□□□□□ -1.013e-15■■■■■ 77.6
PCBP2Q15366 SETD4-208ENST00000424303 796 ntTSL 28.41□□□□□ -1.063e-15■■■■■ 77.6
PCBP2Q15366 SETD4-216ENST00000485865 549 ntTSL 25.19□□□□□ -1.583e-15■■■■■ 77.6
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PCBP2Q15366 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 77.6
PCBP2Q15366 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.957e-8■■■■■ 77.5
PCBP2Q15366 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.467e-8■■■■■ 77.5
PCBP2Q15366 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.227e-8■■■■■ 77.5
PCBP2Q15366 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 77.5
PCBP2Q15366 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.847e-8■■■■■ 77.5
PCBP2Q15366 MPST-207ENST00000485587 5872 ntTSL 216.16■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 77.5
PCBP2Q15366 HAMP-202ENST00000593580 2624 nt11.94□□□□□ -0.52e-22■■■■■ 77.1
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PCBP2Q15366 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-22■■■■■ 77.1
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PCBP2Q15366 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.366e-15■■■■■ 77
PCBP2Q15366 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.996e-15■■■■■ 77
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PCBP2Q15366 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-20■■■■■ 76.8
PCBP2Q15366 CDK17-202ENST00000542666 1769 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.563e-20■■■■■ 76.8
PCBP2Q15366 CDK17-210ENST00000552262 566 ntTSL 310.32□□□□□ -0.763e-20■■■■■ 76.8
PCBP2Q15366 CDK17-211ENST00000552496 583 ntTSL 37.25□□□□□ -1.253e-20■■■■■ 76.8
PCBP2Q15366 CDK17-209ENST00000551816 626 ntTSL 43.84□□□□□ -1.793e-20■■■■■ 76.8
PCBP2Q15366 ARHGEF1-223ENST00000617585 737 ntTSL 220.89■□□□□ 0.936e-14■■■■■ 76.6
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PCBP2Q15366 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-15■■■■■ 76.5
PCBP2Q15366 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-15■■■■■ 76.5
PCBP2Q15366 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.382e-15■■■■■ 76.5
PCBP2Q15366 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.295e-10■■■■■ 76.5
PCBP2Q15366 MCM9-208ENST00000505485 825 ntTSL 415.39■□□□□ 0.057e-20■■■■■ 76.4
PCBP2Q15366 MCM9-203ENST00000368478 469 ntTSL 28.32□□□□□ -1.087e-20■■■■■ 76.4
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PCBP2Q15366 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.941e-323■■■■■ 76.1
PCBP2Q15366 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-323■■■■■ 76.1
PCBP2Q15366 HLA-C-205ENST00000466892 754 nt15.77■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 76.1
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PCBP2Q15366 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.855e-9■■■■■ 75.5
PCBP2Q15366 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.094e-16■■■■■ 75.5
PCBP2Q15366 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-16■■■■■ 75.5
PCBP2Q15366 UHMK1-201ENST00000282169 3345 ntTSL 29.58□□□□□ -0.884e-16■■■■■ 75.5
PCBP2Q15366 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.024e-16■■■■■ 75.5
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PCBP2Q15366 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 75.4
PCBP2Q15366 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-18■■■■■ 75.4
PCBP2Q15366 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-18■■■■■ 75.4
PCBP2Q15366 EPHA2-203ENST00000462805 438 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-15■■■■■ 75.4
PCBP2Q15366 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 75.4
PCBP2Q15366 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.556e-22■■■■■ 75.2
PCBP2Q15366 TMEM18-207ENST00000477202 1767 ntTSL 221.2■□□□□ 0.991e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 TMEM18-202ENST00000355654 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.561e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.848e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-208ENST00000467999 747 ntTSL 516.41■□□□□ 0.228e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-221ENST00000488245 784 ntTSL 515.03■□□□□ -08e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-226ENST00000496334 565 ntTSL 510.79□□□□□ -0.688e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-225ENST00000495020 472 ntTSL 49.04□□□□□ -0.968e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-228ENST00000497883 605 ntTSL 38.38□□□□□ -1.078e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-224ENST00000494536 581 ntTSL 27.49□□□□□ -1.218e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-209ENST00000472047 558 ntTSL 46.69□□□□□ -1.348e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.48e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-222ENST00000491621 753 ntTSL 35.85□□□□□ -1.478e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-210ENST00000475462 560 ntTSL 45.27□□□□□ -1.578e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-218ENST00000487042 889 ntTSL 55.27□□□□□ -1.578e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-211ENST00000475550 4397 ntTSL 1 (best)5.2□□□□□ -1.588e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.628e-20■■■■■ 75
PCBP2Q15366 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.232e-15■■■■■ 74.9
PCBP2Q15366 CEP83-204ENST00000546527 644 ntTSL 215.67■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 74.7
PCBP2Q15366 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 74.7
PCBP2Q15366 NUP205-202ENST00000461255 1447 ntTSL 57.45□□□□□ -1.222e-19■■■■■ 74.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 655.2 ms