RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399208.6

SETD4-205, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-205ENST00000399208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.26■■■■□ 3.56
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SETD4-205ENST00000399208 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.57■■■□□ 2.48
SETD4-205ENST00000399208 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.54■■■□□ 2.48
SETD4-205ENST00000399208 SCRIBQ14160 1630 aa30.54■■■□□ 2.48
SETD4-205ENST00000399208 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
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SETD4-205ENST00000399208 SMARCA4P51532 1647 aa29.12■■■□□ 2.25
SETD4-205ENST00000399208 NESP48681 1621 aa28.98■■■□□ 2.23
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SETD4-205ENST00000399208 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.61■■■□□ 2.17
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SETD4-205ENST00000399208 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.37■■■□□ 2.13
SETD4-205ENST00000399208 WIZO95785 1651 aa28.34■■■□□ 2.13
SETD4-205ENST00000399208 WDR62O43379 1518 aa28.31■■■□□ 2.12
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SETD4-205ENST00000399208 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.2■■■□□ 2.1
SETD4-205ENST00000399208 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.14■■■□□ 2.09
SETD4-205ENST00000399208 CFTRP13569 1480 aa28.08■■■□□ 2.09
SETD4-205ENST00000399208 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SETD4-205ENST00000399208 OSCARQ8IYS5 282 aa27.97■■■□□ 2.07
SETD4-205ENST00000399208 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SETD4-205ENST00000399208 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SETD4-205ENST00000399208 PRDM2Q13029 1718 aa27.77■■■□□ 2.04
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SETD4-205ENST00000399208 IFT140Q96RY7 1462 aa27.65■■■□□ 2.02
SETD4-205ENST00000399208 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
SETD4-205ENST00000399208 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
SETD4-205ENST00000399208 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
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SETD4-205ENST00000399208 TOPBP1Q92547 1522 aa27.57■■■□□ 2
SETD4-205ENST00000399208 ABCC8Q09428 1581 aa27.53■■■□□ 2
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SETD4-205ENST00000399208 CHD1O14646 1710 aa27.31■■□□□ 1.96
SETD4-205ENST00000399208 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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SETD4-205ENST00000399208 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.17■■□□□ 1.94
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SETD4-205ENST00000399208 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SETD4-205ENST00000399208 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SETD4-205ENST00000399208 WDR97A6NE52 1622 aa27.08■■□□□ 1.93
SETD4-205ENST00000399208 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.05■■□□□ 1.92
SETD4-205ENST00000399208 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.05■■□□□ 1.92
SETD4-205ENST00000399208 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 CLASP1Q7Z460 1538 aa27■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 CUX1P39880 1505 aa26.97■■□□□ 1.91
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SETD4-205ENST00000399208 PBRM1Q86U86 1689 aa26.81■■□□□ 1.88
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SETD4-205ENST00000399208 GRIN2AQ12879 1464 aa26.6■■□□□ 1.85
SETD4-205ENST00000399208 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
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SETD4-205ENST00000399208 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.54■■□□□ 1.84
SETD4-205ENST00000399208 ADAMTS12P58397 1594 aa26.53■■□□□ 1.84
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SETD4-205ENST00000399208 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.47■■□□□ 1.83
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SETD4-205ENST00000399208 SHROOM2Q13796 1616 aa26.44■■□□□ 1.82
SETD4-205ENST00000399208 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.41■■□□□ 1.82
SETD4-205ENST00000399208 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
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SETD4-205ENST00000399208 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.24■■□□□ 1.79
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