Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NWD1Q149M9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NWD1Q149M9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
NWD1Q149M9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NWD1Q149M9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NWD1Q149M9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NWD1Q149M9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NWD1Q149M9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NWD1Q149M9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NWD1Q149M9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms