Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB39AQ14964 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB39AQ14964 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB39AQ14964 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB39AQ14964 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB39AQ14964 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB39AQ14964 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB39AQ14964 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB39AQ14964 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB39AQ14964 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB39AQ14964 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB39AQ14964 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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