Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP1BQ14684 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP1BQ14684 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
RRP1BQ14684 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP1BQ14684 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP1BQ14684 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1BQ14684 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1BQ14684 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP1BQ14684 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1BQ14684 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1BQ14684 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1BQ14684 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1BQ14684 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
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