Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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