Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF1Q13905 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAPGEF1Q13905 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAPGEF1Q13905 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAPGEF1Q13905 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAPGEF1Q13905 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF1Q13905 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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