Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P11Q13670 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P11Q13670 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMS2P11Q13670 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P11Q13670 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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