Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PAPPAQ13219 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PAPPAQ13219 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PAPPAQ13219 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PAPPAQ13219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PAPPAQ13219 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PAPPAQ13219 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PAPPAQ13219 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PAPPAQ13219 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PAPPAQ13219 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PAPPAQ13219 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PAPPAQ13219 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PAPPAQ13219 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PAPPAQ13219 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
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