Protein–RNA interactions for Protein: Q13065

GAGE1, G antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE1Q13065 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAGE1Q13065 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GAGE1Q13065 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAGE1Q13065 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAGE1Q13065 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms