Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFX1Q12986 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFX1Q12986 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFX1Q12986 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFX1Q12986 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFX1Q12986 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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