Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4Q12950 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4Q12950 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4Q12950 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4Q12950 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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