Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

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Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH2Q12809 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNH2Q12809 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNH2Q12809 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH2Q12809 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH2Q12809 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH2Q12809 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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