Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CGNL1Q0VF96 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CGNL1Q0VF96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CGNL1Q0VF96 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CGNL1Q0VF96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CGNL1Q0VF96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CGNL1Q0VF96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CGNL1Q0VF96 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CGNL1Q0VF96 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CGNL1Q0VF96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CGNL1Q0VF96 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CGNL1Q0VF96 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CGNL1Q0VF96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CGNL1Q0VF96 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms