Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP4Q09028 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBBP4Q09028 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBBP4Q09028 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP4Q09028 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP4Q09028 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBBP4Q09028 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms