Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP1-1Q07627 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP1-1Q07627 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-1Q07627 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-1Q07627 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP1-1Q07627 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms