Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABPB1Q06547 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPB1Q06547 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPB1Q06547 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GABPB1Q06547 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABPB1Q06547 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABPB1Q06547 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms