Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RELAQ04206 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RELAQ04206 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RELAQ04206 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RELAQ04206 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RELAQ04206 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RELAQ04206 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RELAQ04206 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RELAQ04206 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RELAQ04206 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RELAQ04206 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RELAQ04206 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RELAQ04206 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RELAQ04206 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RELAQ04206 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RELAQ04206 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RELAQ04206 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RELAQ04206 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RELAQ04206 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RELAQ04206 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RELAQ04206 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RELAQ04206 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RELAQ04206 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RELAQ04206 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RELAQ04206 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RELAQ04206 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RELAQ04206 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RELAQ04206 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RELAQ04206 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RELAQ04206 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RELAQ04206 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RELAQ04206 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RELAQ04206 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RELAQ04206 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RELAQ04206 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RELAQ04206 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RELAQ04206 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RELAQ04206 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RELAQ04206 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RELAQ04206 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RELAQ04206 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RELAQ04206 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RELAQ04206 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RELAQ04206 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RELAQ04206 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RELAQ04206 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RELAQ04206 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RELAQ04206 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RELAQ04206 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RELAQ04206 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RELAQ04206 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RELAQ04206 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RELAQ04206 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RELAQ04206 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RELAQ04206 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RELAQ04206 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RELAQ04206 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RELAQ04206 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RELAQ04206 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RELAQ04206 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RELAQ04206 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RELAQ04206 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RELAQ04206 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RELAQ04206 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RELAQ04206 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RELAQ04206 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RELAQ04206 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RELAQ04206 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RELAQ04206 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RELAQ04206 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RELAQ04206 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RELAQ04206 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RELAQ04206 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RELAQ04206 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RELAQ04206 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RELAQ04206 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RELAQ04206 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RELAQ04206 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RELAQ04206 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RELAQ04206 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RELAQ04206 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RELAQ04206 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RELAQ04206 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RELAQ04206 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RELAQ04206 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RELAQ04206 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RELAQ04206 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RELAQ04206 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RELAQ04206 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RELAQ04206 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RELAQ04206 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RELAQ04206 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RELAQ04206 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RELAQ04206 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RELAQ04206 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RELAQ04206 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RELAQ04206 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RELAQ04206 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RELAQ04206 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RELAQ04206 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms