Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms