Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VLDLRP98155 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VLDLRP98155 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VLDLRP98155 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VLDLRP98155 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VLDLRP98155 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VLDLRP98155 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms