Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UFM1P61960 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UFM1P61960 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UFM1P61960 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UFM1P61960 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UFM1P61960 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UFM1P61960 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UFM1P61960 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UFM1P61960 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFM1P61960 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFM1P61960 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFM1P61960 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFM1P61960 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFM1P61960 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFM1P61960 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFM1P61960 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFM1P61960 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFM1P61960 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFM1P61960 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFM1P61960 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFM1P61960 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFM1P61960 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UFM1P61960 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UFM1P61960 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFM1P61960 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFM1P61960 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UFM1P61960 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFM1P61960 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFM1P61960 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UFM1P61960 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFM1P61960 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFM1P61960 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFM1P61960 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UFM1P61960 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UFM1P61960 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UFM1P61960 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UFM1P61960 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UFM1P61960 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UFM1P61960 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UFM1P61960 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UFM1P61960 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UFM1P61960 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UFM1P61960 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UFM1P61960 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UFM1P61960 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UFM1P61960 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UFM1P61960 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UFM1P61960 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UFM1P61960 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UFM1P61960 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFM1P61960 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFM1P61960 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFM1P61960 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFM1P61960 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFM1P61960 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFM1P61960 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFM1P61960 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFM1P61960 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFM1P61960 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFM1P61960 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFM1P61960 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFM1P61960 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFM1P61960 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFM1P61960 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFM1P61960 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFM1P61960 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFM1P61960 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFM1P61960 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFM1P61960 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFM1P61960 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFM1P61960 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UFM1P61960 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UFM1P61960 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFM1P61960 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFM1P61960 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFM1P61960 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UFM1P61960 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFM1P61960 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFM1P61960 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFM1P61960 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UFM1P61960 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFM1P61960 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFM1P61960 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFM1P61960 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFM1P61960 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UFM1P61960 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UFM1P61960 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UFM1P61960 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UFM1P61960 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UFM1P61960 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UFM1P61960 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UFM1P61960 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UFM1P61960 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UFM1P61960 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UFM1P61960 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UFM1P61960 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UFM1P61960 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UFM1P61960 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UFM1P61960 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UFM1P61960 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms