Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPZ1P61923 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPZ1P61923 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPZ1P61923 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms